Coloquio de Física - Secuenciamiento del genoma de la papa y análisis del transcriptoma de papas nativas bajo estrés hídrico usando RNAseq

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Ponente: Gisella Orjeda, Roberto Lozano (Universidad Peruana Cayetano Heredia) La papa es el cuarto cultivo más importante del mundo. Genéticamente, la papa es una especie bastante difícil de mejorar de modo tradicional debido a su genética y biología sexual. El Consorcio del Genoma de la Papa (PGSC) publicó la secuencia y anotación del genoma y desarrolló técnicas efectivas de cartografía genética, y análisis de su transcriptoma, proteoma y metaboloma [Nature 2011, vol. 475]. Todos estos resultados proveen una plataforma de inigualable potencial para el mejoramiento genético de este cultivo, pero debemos generar las competencias bioinformáticas y de mejoramiento asistido por biología molecular para aprovechar este conocimiento, más aún en el marco del cambio climático. En esta presentación hablaremos sobre el secuenciamiento del genoma de la papa en el que participó la Unidad de Genómica (GRU) de UPCH. GRU ha seguido trabajando con la información de la secuencia del genoma de la papa y ha identificado los genes de resistencia presentes en el genoma [PLoS ONE 7, 4] y los genes de calidad en las papas nativas peruanas y está trabajando para identificar los genes implicados en la respuesta a estrés hídrico utilizando tecnologías de secuenciamiento de última generación. Presentaremos los primeros resultados del análisis del transcriptoma de papas nativas bajo estrés hídrico usando la nueva y revolucionaria técnica de secuenciamiento conocida como RNAseq.